Zum Thema Machtgeist:
Bereits in Episode 2 taucht ein kleine Teil von Qui-Gon Jinn wieder auf. Als Anakin die Tusken-Räuber abschlachtet wechselt die Szene in Yodas-Quartier und dort hört man Qui-Gons Stimme "Anakin Nein!!!!!" rufen. Auf der BD gibt es hierzu eine verworfene Szene aus Episode 3 in der Yoda mit Qui-Gon redet und man dessen Stimme hört/hören sollte.
Die Geschichte hierzu ist einfach: Qui-Gonn studierte das "Journal der Whills" und fand darin einen Weg auch nach dem körperlichen Tod als Person in der Macht zu existieren. Allerdings konnte er diese Technik nicht vollenden und so kann er nicht als Machtgeist, sondern nur als Stimme wahrgenommen werden. Nach dem Kontakt mit Yoda lehrt Qui-Gon nun Yoda und Obi-Wan diese Technik und beide können sie vollenden, so dass beide auch als schimmernder Machtgeist erscheinen können.
Warum Anakin dies auch kann wurde nicht offiziell erklärt. Das entsprechende Training hatte er nicht. Es gibt lediglich die Vermutung, dass er diese Fähigkeit hat weil er der Auserwählte ist.

Zum Thema Padme Amidala:
Padmes Tod ist wohl das Unsinnigste an Episode 3. Zumal ich nach wie vor der Meinung bin dass Padme ihren Tod nur vorgetäuscht hat, möglicherweise mit Hilfe von Yoda.
Wenn man mal Lucas' Vorliebe für Figuren-Namen etwas näher anschaut würde ich sagen dass Mon Mothma, die Rebellenfüherin, in Wirklichkeit die untergetauchte Mutter von Luke und Leia ist.

Darth Vader - Lukes Vater. Wobei Vader das niederländische Wort für Vater ist.
Luke Skywalker - Luke dürfte für Lucas stehen und Skywalker könnte man als Träumer übersetzen.
Han Solo - Han der einzelgänische Schmuggler.
Mon Mothma - Mon aus dem französischen "Meine" und Mothma könnte man als Ableitung vom sehr ähnlichen "Mother" (engl. Mutter) verstehen.

Damit würde Mon Mothma übersetzt "Meine Mutter" bedeuten was auf Luke/Lucas bezogen durchaus Sinn machen würde.